Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO28Q9NVF7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO28Q9NVF7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms