Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG6

PDRG1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDRG1Q9NUG6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDRG1Q9NUG6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDRG1Q9NUG6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDRG1Q9NUG6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDRG1Q9NUG6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms