Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms