Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms