Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM1Q9NRU3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms