Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2B1Q9NRF2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms