Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEC31BQ9NQW1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC31BQ9NQW1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC31BQ9NQW1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms