Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPRD1BQ9NQG5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms