Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FZD3Q9NPG1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms