Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1Q9HCU9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms