Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3E2

SNX25, Sorting nexin-25, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25Q9H3E2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX25Q9H3E2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX25Q9H3E2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms