Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF39Q9H2S5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms