Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NLRP1Q9C000 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms