Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC13A1Q9BZW2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms