Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UPF3BQ9BZI7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF3BQ9BZI7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms