Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms