Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRTQ9BXP5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms