Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KATNB1Q9BVA0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KATNB1Q9BVA0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms