Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3CQ9BUI4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3CQ9BUI4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms