Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
THUMPD2Q9BTF0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms