Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms