Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COPS4Q9BT78 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms