Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms