Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPIN3Q9BQK8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms