Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms