Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms