Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP19Q99542 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms