Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOTCH4Q99466 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOTCH4Q99466 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOTCH4Q99466 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOTCH4Q99466 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOTCH4Q99466 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOTCH4Q99466 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOTCH4Q99466 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOTCH4Q99466 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOTCH4Q99466 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NOTCH4Q99466 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NOTCH4Q99466 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms