Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms