Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A12Q96S37 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms