Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A2Q96QD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms