Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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