Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC9Q96Q05 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms