Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPG4P5Q96PW8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms