Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGLYRP2Q96PD5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGLYRP2Q96PD5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms