Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLUHP3Q96NS8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms