Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS1

YPEL4, Protein yippee-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL4Q96NS1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
YPEL4Q96NS1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
YPEL4Q96NS1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms