Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCLT1Q96NL6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms