Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3BQ96NL0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms