Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms