Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP53Q96M91 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CFAP53Q96M91 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP53Q96M91 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms