Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOLD1Q96LR9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOLD1Q96LR9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms