Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX2Q96KN3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms