Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRIQ1Q96JM4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms