Protein–RNA interactions for Protein: Q96HZ4

HES6, Transcription cofactor HES-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES6Q96HZ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES6Q96HZ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES6Q96HZ4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms