Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms