Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms