Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms