Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms