Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECHDC3Q96DC8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHDC3Q96DC8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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